Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr1bP70700 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms