Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms