Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufd1P70362 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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