Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msx3P70354 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msx3P70354 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Msx3P70354 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Msx3P70354 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Msx3P70354 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Msx3P70354 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Msx3P70354 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Msx3P70354 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx3P70354 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx3P70354 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx3P70354 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx3P70354 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx3P70354 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx3P70354 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msx3P70354 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx3P70354 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms