Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stra8P70278 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Stra8P70278 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stra8P70278 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stra8P70278 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stra8P70278 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stra8P70278 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms