Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfixP70257 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfixP70257 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfixP70257 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfixP70257 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfixP70257 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfixP70257 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfixP70257 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfixP70257 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfixP70257 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfixP70257 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfixP70257 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfixP70257 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfixP70257 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfixP70257 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfixP70257 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfixP70257 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfixP70257 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfixP70257 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfixP70257 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfixP70257 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfixP70257 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfixP70257 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfixP70257 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfixP70257 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfixP70257 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfixP70257 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfixP70257 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfixP70257 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfixP70257 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfixP70257 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfixP70257 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfixP70257 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfixP70257 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfixP70257 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NfixP70257 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfixP70257 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfixP70257 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NfixP70257 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfixP70257 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfixP70257 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfixP70257 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfixP70257 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfixP70257 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfixP70257 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfixP70257 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfixP70257 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfixP70257 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfixP70257 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfixP70257 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfixP70257 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfixP70257 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfixP70257 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfixP70257 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfixP70257 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfixP70257 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfixP70257 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfixP70257 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NfixP70257 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfixP70257 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfixP70257 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfixP70257 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfixP70257 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NfixP70257 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NfixP70257 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfixP70257 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfixP70257 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfixP70257 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfixP70257 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfixP70257 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfixP70257 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfixP70257 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfixP70257 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfixP70257 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfixP70257 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfixP70257 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfixP70257 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfixP70257 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfixP70257 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfixP70257 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfixP70257 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfixP70257 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms