Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NficP70255 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NficP70255 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NficP70255 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NficP70255 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NficP70255 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NficP70255 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NficP70255 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NficP70255 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NficP70255 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NficP70255 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NficP70255 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NficP70255 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NficP70255 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NficP70255 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NficP70255 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NficP70255 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NficP70255 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NficP70255 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NficP70255 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NficP70255 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NficP70255 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NficP70255 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NficP70255 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NficP70255 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NficP70255 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NficP70255 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NficP70255 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NficP70255 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NficP70255 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NficP70255 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NficP70255 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NficP70255 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NficP70255 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NficP70255 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NficP70255 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NficP70255 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NficP70255 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NficP70255 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NficP70255 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NficP70255 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NficP70255 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NficP70255 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NficP70255 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NficP70255 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NficP70255 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NficP70255 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NficP70255 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NficP70255 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NficP70255 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NficP70255 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NficP70255 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NficP70255 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NficP70255 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NficP70255 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NficP70255 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms