Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Hoxd13P70217 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Hoxd13P70217 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Hoxd13P70217 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms