Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SbdsP70122 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SbdsP70122 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SbdsP70122 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SbdsP70122 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SbdsP70122 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SbdsP70122 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SbdsP70122 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SbdsP70122 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SbdsP70122 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms