Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acta1P68134 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acta1P68134 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acta1P68134 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acta1P68134 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms