Protein–RNA interactions for Protein: P63271

Supt4h1a, Transcription elongation factor SPT4-A, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt4h1aP63271 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Supt4h1aP63271 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms