Protein–RNA interactions for Protein: P63268

Actg2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg2P63268 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actg2P63268 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actg2P63268 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actg2P63268 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actg2P63268 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actg2P63268 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actg2P63268 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actg2P63268 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actg2P63268 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actg2P63268 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actg2P63268 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actg2P63268 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actg2P63268 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actg2P63268 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actg2P63268 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actg2P63268 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actg2P63268 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg2P63268 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actg2P63268 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms