Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crip1P63254 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crip1P63254 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crip1P63254 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Crip1P63254 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Crip1P63254 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Crip1P63254 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Crip1P63254 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Crip1P63254 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms