Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barhl1P63157 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms