Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtnP63089 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtnP63089 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtnP63089 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtnP63089 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtnP63089 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtnP63089 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtnP63089 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtnP63089 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtnP63089 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtnP63089 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtnP63089 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtnP63089 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtnP63089 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtnP63089 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtnP63089 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtnP63089 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtnP63089 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtnP63089 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtnP63089 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtnP63089 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtnP63089 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtnP63089 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtnP63089 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtnP63089 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtnP63089 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtnP63089 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtnP63089 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtnP63089 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtnP63089 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtnP63089 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtnP63089 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtnP63089 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtnP63089 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtnP63089 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtnP63089 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtnP63089 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtnP63089 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtnP63089 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtnP63089 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtnP63089 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtnP63089 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtnP63089 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtnP63089 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtnP63089 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtnP63089 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtnP63089 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtnP63089 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtnP63089 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtnP63089 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtnP63089 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtnP63089 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtnP63089 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtnP63089 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtnP63089 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtnP63089 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtnP63089 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtnP63089 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtnP63089 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtnP63089 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtnP63089 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms