Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UbdP63072 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UbdP63072 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbdP63072 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbdP63072 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbdP63072 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UbdP63072 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UbdP63072 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbdP63072 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbdP63072 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbdP63072 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbdP63072 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbdP63072 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbdP63072 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbdP63072 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbdP63072 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbdP63072 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbdP63072 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbdP63072 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbdP63072 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbdP63072 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbdP63072 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbdP63072 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbdP63072 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbdP63072 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbdP63072 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbdP63072 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbdP63072 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbdP63072 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbdP63072 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbdP63072 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbdP63072 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UbdP63072 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UbdP63072 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UbdP63072 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UbdP63072 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UbdP63072 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UbdP63072 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UbdP63072 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UbdP63072 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbdP63072 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UbdP63072 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbdP63072 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbdP63072 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbdP63072 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbdP63072 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbdP63072 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbdP63072 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbdP63072 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbdP63072 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbdP63072 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbdP63072 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbdP63072 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbdP63072 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbdP63072 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbdP63072 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbdP63072 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbdP63072 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbdP63072 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbdP63072 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbdP63072 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbdP63072 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbdP63072 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbdP63072 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbdP63072 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms