Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms