Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms