Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps28P62858 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps28P62858 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms