Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rab3cP62823 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rab3cP62823 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rab3cP62823 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rab3cP62823 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rab3cP62823 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rab3cP62823 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rab3cP62823 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rab3cP62823 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rab3cP62823 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rab3cP62823 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rab3cP62823 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rab3cP62823 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3cP62823 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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