Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab1AP62821 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab1AP62821 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms