Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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