Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan5P62080 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms