Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk5r1P61809 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r1P61809 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms