Protein–RNA interactions for Protein: P60882

Megf8, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 2,789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Megf8P60882 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Megf8P60882 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Megf8P60882 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Megf8P60882 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Megf8P60882 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Megf8P60882 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Megf8P60882 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Megf8P60882 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Megf8P60882 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Megf8P60882 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms