Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdsp1P58466 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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