Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TdgP56581 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TdgP56581 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TdgP56581 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TdgP56581 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TdgP56581 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TdgP56581 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TdgP56581 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TdgP56581 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TdgP56581 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TdgP56581 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TdgP56581 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TdgP56581 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TdgP56581 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TdgP56581 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TdgP56581 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TdgP56581 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TdgP56581 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TdgP56581 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TdgP56581 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TdgP56581 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TdgP56581 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TdgP56581 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TdgP56581 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TdgP56581 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TdgP56581 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TdgP56581 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TdgP56581 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TdgP56581 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TdgP56581 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TdgP56581 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TdgP56581 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TdgP56581 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TdgP56581 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TdgP56581 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TdgP56581 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TdgP56581 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TdgP56581 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TdgP56581 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TdgP56581 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TdgP56581 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TdgP56581 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TdgP56581 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TdgP56581 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TdgP56581 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TdgP56581 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TdgP56581 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TdgP56581 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TdgP56581 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TdgP56581 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TdgP56581 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TdgP56581 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TdgP56581 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TdgP56581 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TdgP56581 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TdgP56581 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TdgP56581 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TdgP56581 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TdgP56581 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TdgP56581 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TdgP56581 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TdgP56581 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TdgP56581 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TdgP56581 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TdgP56581 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TdgP56581 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TdgP56581 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TdgP56581 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TdgP56581 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TdgP56581 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TdgP56581 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TdgP56581 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TdgP56581 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TdgP56581 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TdgP56581 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TdgP56581 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TdgP56581 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TdgP56581 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TdgP56581 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TdgP56581 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TdgP56581 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TdgP56581 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TdgP56581 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TdgP56581 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms