Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gp1bbP56400 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms