Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Abcd3P55096 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms