Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acod1P54987 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms