Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms