Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms