Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp1P52624 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp1P52624 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp1P52624 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Upp1P52624 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp1P52624 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp1P52624 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp1P52624 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms