Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2e3P52483 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms