Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ClgnP52194 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ClgnP52194 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ClgnP52194 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClgnP52194 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClgnP52194 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms