Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr4P51680 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms