Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Opn1swP51491 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn1swP51491 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn1swP51491 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Opn1swP51491 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms