Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csrp3P50462 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms