Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SftpdP50404 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SftpdP50404 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SftpdP50404 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SftpdP50404 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms