Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp9P49962 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp9P49962 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp9P49962 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp9P49962 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp9P49962 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms