Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb42P49222 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb42P49222 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb42P49222 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epb42P49222 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epb42P49222 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epb42P49222 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms