Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms