Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptx3P48759 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms