Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prox1P48437 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prox1P48437 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prox1P48437 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms