Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcd1P48410 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms