Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrprbP47758 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrprbP47758 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrprbP47758 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrprbP47758 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrprbP47758 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrprbP47758 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrprbP47758 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SrprbP47758 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrprbP47758 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms