Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgavP43406 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgavP43406 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ItgavP43406 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ItgavP43406 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms