Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec3bP43025 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms