Protein–RNA interactions for Protein: P39688

Fyn, Tyrosine-protein kinase Fyn, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FynP39688 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FynP39688 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FynP39688 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FynP39688 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FynP39688 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FynP39688 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FynP39688 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FynP39688 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FynP39688 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FynP39688 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FynP39688 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FynP39688 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FynP39688 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FynP39688 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FynP39688 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FynP39688 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FynP39688 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FynP39688 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FynP39688 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FynP39688 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FynP39688 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FynP39688 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FynP39688 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FynP39688 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FynP39688 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FynP39688 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FynP39688 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FynP39688 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FynP39688 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FynP39688 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FynP39688 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FynP39688 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FynP39688 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FynP39688 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FynP39688 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FynP39688 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FynP39688 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FynP39688 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FynP39688 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FynP39688 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FynP39688 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FynP39688 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FynP39688 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FynP39688 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FynP39688 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FynP39688 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FynP39688 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FynP39688 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FynP39688 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FynP39688 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FynP39688 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FynP39688 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FynP39688 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FynP39688 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FynP39688 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FynP39688 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FynP39688 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FynP39688 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FynP39688 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FynP39688 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FynP39688 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FynP39688 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FynP39688 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FynP39688 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FynP39688 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FynP39688 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FynP39688 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FynP39688 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FynP39688 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FynP39688 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FynP39688 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FynP39688 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FynP39688 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FynP39688 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FynP39688 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FynP39688 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FynP39688 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FynP39688 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms