Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpargP37238 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpargP37238 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpargP37238 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpargP37238 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpargP37238 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpargP37238 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpargP37238 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PpargP37238 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpargP37238 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpargP37238 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpargP37238 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpargP37238 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpargP37238 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpargP37238 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpargP37238 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpargP37238 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpargP37238 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpargP37238 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpargP37238 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpargP37238 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PpargP37238 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PpargP37238 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PpargP37238 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpargP37238 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpargP37238 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpargP37238 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpargP37238 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpargP37238 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpargP37238 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpargP37238 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpargP37238 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpargP37238 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpargP37238 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpargP37238 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpargP37238 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpargP37238 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PpargP37238 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PpargP37238 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PpargP37238 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PpargP37238 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PpargP37238 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PpargP37238 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PpargP37238 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PpargP37238 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PpargP37238 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PpargP37238 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PpargP37238 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PpargP37238 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PpargP37238 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PpargP37238 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PpargP37238 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PpargP37238 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PpargP37238 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PpargP37238 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PpargP37238 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PpargP37238 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PpargP37238 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PpargP37238 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PpargP37238 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PpargP37238 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PpargP37238 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PpargP37238 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PpargP37238 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms